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【Awards】本课题组因报道“首个可分辨20种蛋白质氨基酸及其翻译后修饰的纳米孔”获评2023年度“中国生物信息学十大进展”

发布时间:2024-03-17 

2023年度“中国生物信息学十大进展”公布

为推动我国生物信息学的学科发展和创新研究,充分展示和宣传我国生物信息学领域的重大研究成果,《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文)》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB)组织评选了2018年度2019年度2020年度2021年度2022年度“中国生物信息学十大进展”。在此基础上,GPB继续组织2023年度评选活动,经过100余名国内外生物信息学领域教授/研究员推荐,初选、复选投票,以及复核程序,现公布2023年度“中国生物信息学十大进展”评选结果(排名不分先后,按标题首字母顺序排序)。
感谢所有专家秉持专业和公正的态度参与本年度十大进展的推荐和评选;祝贺所有入选工作的团队!同时祝愿大家在2024新的一年里健康平安、工作顺利、大展宏图、硕果累累!
                                             评审委员会
                                        2024年3月16日




基于工程化纳米孔的氨基酸及其翻译后修饰检测


蛋白质是生命活动的执行者,蛋白质序列的准确测定对于理解蛋白质的结构和功能至关重要。南京大学黄硕团队构建了一种高分辨率的工程化纳米孔,在孔道的传感区域精准引入了一个镍离子-次氮基三乙酸(Ni-NTA)适配器,借助金属离子与氨基酸之间的配位相互作用实现了20种蛋白质氨基酸和4种经典的翻译后修饰(磷酸化、糖基化、乙酰化、甲基化)的直接检测与完全区分,机器学习准确率可达98.6%。该策略被进一步应用于肽的氨基酸组成鉴定,为基于纳米孔的单分子蛋白质测序方法的开发提供了重要的设计策略和坚实的分辨率基础。

该成果发表于Nature Methods

推荐理由:首个能够识别20种天然蛋白质氨基酸的纳米孔测序和分析技术

镍离子修饰纳米孔道实现20种蛋白质氨基酸全分辨





原文信息





Wang K, Zhang S, Zhou X, Yang X, Li X, Wang Y, et al. Unambiguous discrimination of all 20 proteinogenic amino acids and their modifications by nanopore. Nature Methods 2024;21:92–101. PMID: 37749214.





原文链接



https://doi.org/10.1038/s41592-023-02021-8

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