Prof.Huang

     黄硕,教授、博士生导师

南京大学化学化工学院,生命分析化学国家重点实验室,南京大学化学和生物医药创新研究院(ChemBIC)

国家自然科学基金杰出青年(2022年),国家海外引才(青年)(2015年),江苏省“杰出青年”(2020年),江苏省“双创团队”领军人才(2020年),江苏省“双创人才”(2017年)


办公室:化学化工学院D305
电 话:025-89681920(实验室)/89681921(办公室)
电子邮件:shuo.huang@nju.edu.cn

2006年于南京大学物理系获得物理学学士学位;2011年于美国亚利桑那州立大学获得生物物理学博士学位; 导师是Stuart Lindsay教授;2011年至2015年在英国牛津大学从事博士后研究工作,导师是Hagan Bayley教授。 2015年7月应聘南京大学化学化工学院教授。现从事主要科研方向为具有仿生学概念的单分子纳米孔生物传感器的新仪器、新技术的开发以及基于纳米孔的单分子显微成像技术。其中在纳米孔单分子成像方面具有原创性技术, 具有国际前沿研发水平。目前已于国际权威期刊Nature Methods,Nature Nanotechnology,Nature Communications,Journal of the American Chemical Society, Science Advances,Angewandte Chemie International Edition, ACS Nano, Nano Letters等期刊发表论文若干。 其中以第一作者发表Nature Nanotechnology 2篇,并入选2010年12月刊封面;以唯一通讯作者发表Nature Methods 1篇, Nature Nanotechnology 1篇,并入选2022年9月刊封面。已授权国际专利两项、国内专利1项,申请PCT专利若干项。

 

主研方向:
  单分子生物物理,基于纳米孔器件的单分子生物传感器,具有临床检测功能的单分子医疗诊断。


主持科研项目:

  1. 国家自然科学基金杰出青年基金

  2. 国家级重大人才工程A类(青年项目)

  3. 国家自然科学基金面上项目/重大研究计划培育项目

  4. 国家重点研发计划子课题

  5. 江苏省“双创团队”项目基金

  6. 江苏省“双创人才”项目基金

  7. 江苏省“杰出青年”项目基金

  8. 中央高校基本科研业务费(国际科技合作促进项目/原创与交叉研究培育基金

  9. 南京大学技术创新基金项目

代表性论著:

【1】 Wang, K. #; Zhang, S. #; Zhou, X. #; Yang, X.; Li, X.; Wang, Y.; Fan, P.; Xiao, Y.; Sun, W.; Zhang, P.; Li, W.; Huang, S.*; Unambiguous discrimination of all 20 proteinogenic amino acids and their modifications by nanopore. Nature Methods 2024,   21 (1), 92-101.

【2】 Wang, Y.#; Zhang, S. #; Jia, W. #; Fan, P.; Wang, L.; Li, X.; Chen, J.; Cao, Z.; Du, X.; Liu, Y.; Wang, K.; Hu, C.; Zhang, J.; Hu, J., Zhang, P.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, Identification of nucleoside monophosphates and their epigenetic modifications using an engineered nanopore.  Nature Nanotechnology 2022, 17 (9), 976-983.

【3】 Liu, Y.#; Zhang, S.#; Wang, Y.; Wang, L.; Cao, Z.; Sun, W.; Fan, P.; Zhang, P.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, Nanopore identification of alditol epimers and their application in rapid analysis of alditol-containing drinks and healthcare products. Journal of the American Chemical Society 2022,144(30), 13717–13728

【4】 Liu, Y.; Wang, K.; Wang, Y.; Yan, S.; Du, X.; Zhang, P.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, Machine Learning assisted simultaneous structural profiling of differently charged proteins in a Mycobacterium smegmatis porin A (MspA) electroosmotic trap. Journal of the American Chemical Society 2022,144(2), 757–768

【5】Wang, Y.; Wang, Y.; Du, X.; Yan, S.; Zhang, P.; Chen, H.-Y. * Huang, S.*, Electrode-free nanopore sensing by DiffusiOptoPhysiology, Science Advances 2019, 5(9), eaar3309.

【6】 Zhang, S.#; Cao, Z. #; Fan, P. #; Sun, W.; Xiao, Y.; Zhang, P.; Wang, Y.*; Huang, S.*, Discrimination of Disaccharide Isomers of Different Glycosidic Linkages Using a Modified MspA Nanopore. Angewandte Chemie International Edition 2024, e202316766.

【7】 Yang, J. #; Wang, K. #; Zhang, S.; Zheng, X.; Cui, T.; Yang, X.; Liu, Y.; Lu, D.; Wang, Y.; Tian, X.; Zhang, P.; Huang, S.*; Xie, R. *, Site-Specific Introduction of Bioorthogonal Handles to Nanopores by Genetic Code Expansion. Angewandte Chemie International Edition 2023 , 62(21):e202216115

【8】 Zhang, S.#; Cao, Z.#; Fan, P.#; Wang, Y.; Jia, W.; Wang, L.; Wang, K.; Liu, Y.; Du, X.; Hu, C.; Zhang, P.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, A Nanopore-Based Saccharide Sensor. Angewandte Chemie International Edition 2022  61(33):e202203769

【9】 Yan, S.#; Wang, L.#; Wang, Y.; Cao, Z.; Zhang, S.; Du, X.; Fan, P.; Zhang, P.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, Non-binary Encoded Nucleic Acid Barcodes Directly Readable by a Nanopore. Angewandte Chemie International Edition 2022, 61 (20), e202116482.

【10】 Liu, Y.; Pan, T.; Wang, K.; Wang, Y.; Yan, S.; Wang, L.; Zhang, S.; Du, X.; Jia, W.; Zhang, P.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, Allosteric Switching of Calmodulin in a Mycobacterium smegmatis porin A (MspA) Nanopore-Trap. Angewandte Chemie International Edition 2021, 60(44), 23863–23870

【11】 Wang, Y. #; Patil, K. M. #; Yan, S.; Zhang, P.; Guo, W.; Wang, Y.; Chen, H.-Y.; Gillingham, D. *Huang, S.*, Nanopore Sequencing Accurately Identifies the Mutagenic DNA Lesion O6-Carboxymethyl Guanine and Reveals Its Behavior in Replication, Angewandte Chemie International Edition 2019, 58(25), 8432-8436.

【12】 Fan, P.#; Cao, Z.#; Zhang, S.#; Wang, Y.; Xiao, Y.; Jia, W.; Zhang, P.; Huang, S.*, Nanopore analysis of cis-diols in fruits. Nature Communications 2024,15 (1), 1969

【13】 Fan, P.#; Zhang, S.#; Wang, Y.; Li, T.; Zhang, H.; Zhang, P.; Huang, S.*, Nanopore analysis of salvianolic acids in herbal medicines. Nature Communications 2024,15 (1), 1970

【14】 Jia, W.; Hu, C.; Wang, Y.; Gu, Y.; Qian, G.; Du, X.; Wang, L.; Liu, Y.; Cao, J.; Zhang, S.; Yan, S.; Zhang, P.; Ma, J.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, Programmable Nano-Reactors for Stochastic Sensing. Nature Communications 2021.12(1), 5811 

【15】 Wang, Y. #; Guan, X. #; Zhang, S.; Liu, Y.; Wang, S.; Fan, P.; Du, X.; Yan, S.; Zhang, P.; Chen, H.-Y.; Li, W. *; Zhang, D. *Huang, S.*, Structural-profiling of low molecular weight RNAs by nanopore trapping/translocation using Mycobacterium smegmatis porin A, Nature Communications 2021, 12(1), 3368. 

【16】 Cao, J.; Jia, W.; Zhang, J.; Xu, X.; Yan, S.; Wang, Y.; Zhang, P.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, Giant single molecule chemistry events observed from a tetrachloroaurate(III) embedded Mycobacterium smegmatis porin A nanopore,  Nature Communications 2019, 10(1), 5668.

【17】 Du, X.#; Zhang, S.#; Wang, L.; Wang, Y.; Fan, P.;Jia, W.; Zhang, P.; Huang, S.*, Single Molecule-Interconversion between Chiral Configurations of Boronate Esters Observed in a Nanoreactor.ACS Nano 2023, 17(3), 2881–2892

【18】 Wang, Y.#; Fan, P.#; Zhang, S.; Wang, L.; Li, X.; Jia, W.;Liu, Y.; Wang, K.; Du, X.; Zhang, P.; Huang, S.*, Discrimination of ribonucleoside mono-, di-, and triphosphates using an engineered nanopore.ACS Nano 2022,16(12), 21356–21365

【19】 Jia, W.; Hu, C.; Wang, Y.; Liu, Y.; Wang, L.; Zhang, S.; Zhu, Q.; Gu, Y.; Zhang, P.; Ma, J.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, Identification of Single-Molecule Catecholamine Enantiomers Using a Programmable Nanopore, ACS Nano 2022, 16(4): 6615-6624.

【20】 Wang, K.#; Yang, X.#; Xiao, Y.; Cao, Z.; Zhang, S.; Zhang, P.; Huang, S.*, Simultaneous Identification of Major Thyroid Hormones by a Nickel Immobilized Biological Nanopore. Nano Letters 2024, 24(1), 305–311

【21】 Jia, W.; Ouyang, Y.; Zhang, S.; Du, X.; Zhang, P.; Huang, S.*, Nanopore Signatures of Nucleoside Drugs. Nano Letters 2023.  23(20), 9437–9444

【22】 Wang, K. #; Yang, X. #; Zhang, S.; Zhang, P.; Huang, S.*, Nanopore Discrimination of Nucleotide Sugars. Nano Letters 2023. 23(18), 8620–8627

【23】 Yan, S.; Zhang, J.; Wang, Y.; Guo, W.; Zhang, S.; Liu, Y.; Cao, J.; Wang, Y.; Wang, L.; Ma, F.; Zhang, P.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, Single Molecule Ratcheting Motion of Peptides in a Mycobacterium smegmatis Porin A (MspA) Nanopore,  Nano Letters 2021, 21(15), 6703-6710.

【24】 Zhang, J. #; Wang, Y. #; Wang, Y.; Zhang, P.; Chen, H.-Y.; Huang, S.*, Discrimination between different DNA lesions by monitoring single molecule polymerase stalling kinetics during nanopore sequencing. Nano Letters 202222(13), 5561–5569

【25】 Huang,S.#; Romero-Ruiz, M.#; Castell, O. K.; Bayley, H.; Wallace, M. I.*, High-throughput optical sensing of nucleic acids in a nanopore array. Nature Nanotechnology 2015, 10(11), 986-991. 

【26】 Huang,S.; He, J.; Chang, S.; Zhang, P. M.; Liang, F.; Li, S. Q.; Tuchband, M.; Fuhrmann, A.; Ros, R.; Lindsay, S.*, Identifying single bases in a DNA oligomer with electron tunnelling. Nature Nanotechnology 2010, 5 (12), 868-873.


Address: Prof. Shuo Huang Room A220/A221 School of Chemistry & Chemical Engineering

Nanjing University 163 Xianlin Ave, Nanjing, China 210023

Email: shuo.huang@nju.edu.cn

TEL: 025-89681920(Lab)/89681921(Office)

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